Anafranil é usado para tratar a depressão e distúrbios do humor, além de outras condições como estados de pânico e fobias, dor crônica e fraqueza muscular (cataplexia) associados com ataques repetidos de sonolência excessiva (narcolepsia) em adultos, ejaculação precoce. Em crianças acima de 5 anos, Anafranil é utilizado para tratar obsessões e incontinência urinária noturna.