O Depakene se dissocia em íon valproato no trato gastrointestinal. Seu mecanismo de ação ainda não é totalmente conhecido, mas sua atividade parece estar relacionada com o aumento dos níveis do ácido gama-aminobutírico no cérebro. O tratamento com Depakene, em alguns casos, pode produzir sinais de melhora já nos primeiros dias de tratamento.